阿拉山口出入境檢驗檢疫局駐守在第二座亞歐大陸橋中國西段橋頭堡、我國西北地區唯一的鐵路、公路和輸油管道并舉的阿拉山口口岸，負責博爾塔拉蒙古自治州境內和阿拉山口口岸出入境衛生檢疫、動植物檢疫、商品檢驗鑒定、認證和監督管理等工作的涉外經濟行政監督執法機構。內設辦公室、財務管理科、后勤管理科、檢務科、鐵路檢驗檢疫監管科、公路檢驗檢疫監管科、石油檢驗監管科和衛生檢疫監管科8個職能科室。
