根據黨中央、國務院全面加強疾病預防控制體系建設的指導思想, 2003年11月28日,河南省機構編制委員會正式批準,在原河南省衛生防疫站和河南省結核病防治研究所的基礎上組建河南省疾病預防控制中心,機構規格為副廳級,核定事業編制470人,經費實行全額預算管理,作為政府舉辦的實施疾病預防控制、公共衛生技術管理與服務的公益性事業單位。2004年6月11日,河南省疾病預防控制中心正式成立。
威海市疾病預防控制中心于2001年更名成立,為正處級全額事業單位。編制65人,實有61人。有專業技術人員45人,其中博、碩士研究生15人、本科25人;副高級以上職稱16人、中級職稱26人。內設辦公室、應急辦公室、綜合科、傳染病防制科、疫情與信息管理科、結核病(艾滋病)防制科、環境衛生科、食品衛生科、消毒與有害生物防制科、慢性病與地方病防制科、免疫規劃科、檢驗科、質量管理辦公室、健康促進中心等14個科室。