阜新市疾病預防控制中心成立于2003年11月17日，由原市衛生防疫站、市結核病防治所、市健康教育所、市職業病防治所四家單位合并而成。
鹽城市疾病預防控制中心成立于2002年7月12日，為副處級建制全額事業單位。內設2個職能科室和10個業務科室，核定編制98人。現有各類專業技術人員89名，其中，高級職稱34名，中級職稱20名。中心現為南京醫科大學MPH（公共衛生碩士）、南通大學教學基地。江蘇省和鹽城市文明單位。中心于2005年年底搬遷至現址（鹽城市區毓龍東路66號）。
南昌市疾病預防控制中心是實施政府疾病預防與控制、公共衛生技術管理與服務職能的公益性事業單位。于2004年11月，在原南昌市衛生防疫站、南昌市職業病防治所基礎上組建成立。南昌市衛生檢測檢驗中心、江西省乳制品質量監督檢驗站掛靠中心。
潮州市疾病預防控制中心（潮州市衛生檢驗中心）于2002年12月在原潮州市衛生防疫站的基礎上組建成立，是同級政府衛生防病工作的技術保障部門和疾病預防控制研究及技術服務的專業機構。
合肥市疾病預防控制中心是根據衛生部關于衛生監督體制改革意見及安徽省有關衛生監督和防病體制改革的精神，在原合肥市衛生防疫站基礎上，經合肥市機構編制委員會批準，于2003年3月20日組建的政府實施疾病預防控制與公共衛生技術管理和衛生監測檢驗技術服務的公益事業單位，是集疾病預防與控制，衛生檢測與評價，健康教育與促進，業務培訓、指導與技術咨詢服務為一體的新型疾病預防控制機構。
楊浦區疾病預防控制中心（簡稱區疾控中心）是政府舉辦的實施疾病預防控制、公共衛生技術管理和服務的全額撥款的公益性事業單位，承擔轄區內 100多萬人口的疾病預防與控制、疫情收集與報告、應急預警與處置、監測檢驗與評價、健康教育與促進、科學研究與應用、技術指導與管理、技術支撐與服務等工作。區疾控中心為復旦大學數學科學院、同濟大學醫學院、水產大學食品學院、復旦大學醫藥高等專科學校和上海工會管理職業學院等高等院校教學基地。
上海市寶山區疾病預防控制中心的前身是1951年建立的原上海市江灣、大場、吳淞、新市四個區衛生防疫站（1956年合并為上海市北郊區衛生防疫站和血吸蟲病防治站）及1956建立的原江蘇省寶山縣血吸蟲病防治站。
成都市疾病預防控制中心成立于2002年3月28日，由原成都市衛生防疫站、成都市第二衛生防疫站和成都市健康教育所優化組建而成，是市政府舉辦的公益一類事業單位，是對重大污染、重大中毒、重大疫情、重大災害等突發事件實行危機管理的技術中心，是全市疾病預防控制、健康教育、健康促進的業務指導中心，是美國南加州大學、四川大學、瀘州醫學院等教學實習基地。
成都市武侯區疾病預防控制中心地址設在有著3000余年的建城史，故有“錦官城”之稱的成都，四川省成都市武侯區廣福橋街６號，主要經營為人民身體健康提供防疫保障、疾病監測、疾病防治研究、疾病預防與控制、衛生監督與監測、衛生宣傳與健康教育、衛生防疫培訓與技術指導等，于2003年3月11日在成都工商局登記注冊掛牌成立
自貢疾控中心占地16.49畝，建筑面積14984.59平方米，其中實驗室5769.13平方米，實驗室檢測設備固定資產達3215萬元。中心設有14個業務所和4個職能科室，在崗職工174人，其中在編職工146人。建成省級重點實驗室1個，市級重點專科3個，疑難細菌鑒定中心1個。中心職工當選國家級學術專委會委員、獲省醫療衛生終身成就獎、自貢市首屆優秀專家、自貢市大美醫生等殊榮；二人入選“自貢市千人計劃”優秀專家。
廣州市疾病預防控制中心（掛廣州市衛生檢驗中心、廣州市食品安全風險監測與評估中心牌子），原名廣州市衛生防疫站，是廣州市衛生和計劃生育委員會下屬的正處級公益一類事業單位。擔負著廣州市傳染病和慢性非傳染性疾病的預防控制、相關產品的衛生學檢驗與評價、衛生監督監測等業務工作，是全市疾病預防控制和衛生監督檢驗檢測的指導中心。
淮安市疾病預防控制中心（淮安市衛生檢測檢驗中心）為淮安市衛計委下屬的副處級公益性事業單位。于2003年3月，根據疾病預防控制體制改革的要求，在原淮安市衛生防疫站的基礎上組建成立。主要承擔全市疾病預防與控制、突發公共衛生事件應急處置、疫情報告及健康相關因素信息管理、健康危害因素監測與控制、實驗室檢測與評價、健康教育與健康促進、技術指導與應用研究等政府對社會的疾病預防控制職能。
丹陽市疾病預防控制中心成立于2003年4月28日，由原市衛生防疫站和市皮膚病防治所整合組建而成，同時增掛“丹陽市衛生監測檢驗中心”牌子，為獨立法人全民事業單位，主要工作職責是依據國家法律法規履行疾病預防控制、衛生檢測檢驗和健康教育與促進等工作職能，是向社會提供衛生監測服務，并出具具有證明作用數據和結果的法定專業機構。單位長期以來堅持預防為主方針，應用預防醫學理論和現代科技手段，開展疾病預防控制、衛生監督檢測、教學科研和健康教育與促進等公共衛生工作，在傳染病防治、計劃免疫、食品衛生、環境衛生、放射衛生、職業衛生、學校衛生等工作方面取得了顯著成效。
清遠市疾病預防控制中心（清遠市衛生檢驗中心）成立于2001年3月,為清遠市衛生局管理的公益一類事業單位，目前擁有各類專業技術人員122人，其中中高級專業技術人員占40％。該中心新辦公大樓于2007年投入使用，占地面積14096平方米，由六層高的四幢建筑組成。 作為同級政府衛生防病工作的技術部門和疾病預防控制研究、技術服務的專業機構，中心主要承擔的職責有：組織實施全市疾病預防控制規劃、計劃；開展傳染病監測與預測預警，參與重大預防接種事故調查處置；組織實施公共衛生健康危害因素監測與干預，承擔突發公共衛生事件危害因素的技術調查，實施控制措施；承擔開展病原微生物、毒物、污染物、衛生行政主管部門委托的與衛生執法相關的檢測、檢驗及相關鑒定工作；組織實施全市疾病預防控制機構業務考核工作，指導轄區內醫療衛生機構傳染病防治工作；建設市級疾病預防控制公共衛生信息平臺；開展和指導全市疾病預防控制相關健康教育和促進工作；開展疾病預防控制應用性科學研究。
成都市疾病預防控制中心是成都市政府實施疾病預防控制與公共衛生技術管理和服務的公益性事業單位。
