湖南省疾病預防控制中心 是在撤消原省衛生防疫站，歸并省健康教育所、省皮膚病防治研究所的基礎上重新組建而成的湖南省衛生和計劃生育委員會直屬衛生事業單位，是全省疾病預防控制、衛生檢測檢驗、健康教育、預防醫學科研、預防技術咨詢與服務的中心，也是疾病控制機構的業務領導、技術考核和專業人員培訓中心。
北京市疾病預防控制中心、北京市預防醫學研究中心是根據國務院關于衛生監督、衛生防病體制改革的總體要求，在北京市衛生防疫站、北京市勞動衛生與職業病防治研究所、北京市健康教育所、北京市性病防治所的基礎上，于2000年6月正式組建的市級衛生事業單位。
揚州市疾病預防控制中心是在市衛生局領導下的副處級全民事業單位（同時掛揚州市衛生檢測中心牌子），組建于2003年1月，是負責全市疾病預防與控制、突發公共衛生事件應急處置、疫情及健康相關因素信息管理、健康危害因素監測與控制、實驗室檢測分析與評價、健康教育與健康促進、技術指導與應用研究、科學研究的技術服務中心，也是南京醫科大學(MPH)、南京中醫藥大學、江蘇大學、南通大學、徐州醫學院、蚌埠醫學院教學實習基地。
中國疾病預防控制中心性病艾滋病預防控制中心的前身為“衛生部艾滋病預防控制中心”，隸屬于中國預防醫學科學院，成立于1998年7月，是經國務院批準的艾滋病預防控制專業機構。2002年1月23日中國預防醫學科學院更名為中國疾病預防控制中心，衛生部艾滋病預防與控制中心更名為“中國疾病預防控制中心性病艾滋病預防控制中心”，簡稱“艾防中心”，為中國疾病預防控制中心下屬的一個二級單位。
浙江省疾病預防控制中心，成立于2000年6月，前身為成立于1953年的浙江省衛生防疫站，是直屬于浙江省衛生健康委的公益一類事業單位，機構規格相當于副廳級，內設6個正處級職能處室、11個正處級業務所。
深圳市龍崗區疾病預防控制中心（龍崗區衛生檢驗中心）于2004年10月在原龍崗區衛生防疫站基礎上成立的，直屬于龍崗區衛生局的事業單位。是龍崗區疾病預防控制、衛生監測檢驗、科研培訓和宣傳教育的技術指導中心。
2000年10月，經省政府（蘇編〔2000〕21號和44號）批準,由原江蘇省衛生防疫站（省結核病防治所）、江蘇省職業病防治所（省職業病防治院）、江蘇省衛生宣傳教育所和江蘇省皮膚病防治研究所（省性病監測中心）合并組建江蘇省疾病預防控制中心，是直屬江蘇省衛生和計劃生育委員會領導的主要從事疾病預防控制工作的公益性事業單位。
安慶市疾病預防控制中心
天津市疾病預防控制中心是天津市政府舉辦的實施全市疾病預防控制與公共衛生技術管理和服務的公益事業單位，是實施政府公共衛生職能的核心專業機構，是天津市衛生安全體系的重要組成部分，是在市政府衛生計生行政部門領導下，組織實施全市衛生防病工作的技術保障部門，同時承擔對區防治機構的業務指導、考核和技術示范職能。原為天津市衛生防疫站，始建于1953年，1984年更名為天津市衛生防病中心，2006年更名為天津市疾病預防控制中心（以下簡稱“天津疾控中心”）。
廈門市疾病預防控制中心是在原廈門市衛生防疫站的基礎上于 2003 年 7 月組建而成，是全市疾病預防與控制的技術指導中心和技術咨詢、服務機構，是政府實施疾病預防與控制、突發公共衛生事件應急處置、疫情報告及健康相關因素信息管理、健康危害因素監測與干預、實驗室檢測分析與評價、健康教育與健康促進、技術管理與應用研究指導等職能的公益性事業單位。
廣東省疾病預防控制中心是全省突發公共衛生事件應急處置和疾病預防控制技術指導中心，是隸屬于廣東省衛生健康委的副廳級公益一類事業單位。它組建于2000年12月28日，前身為成立于1952年的粵穗衛生防疫站。
上海市疾病預防控制中心是實施市政府衛生防病職能的公共衛生核心專業機構，集疾病預防控制與應急、監測檢驗與評價、應用科研與指導、技術管理與服務、綜合防治與健康促進為一體，旨在預防和控制危險因素、疾病、傷害和失能，提高全人群健康水平和生命質量。
德清縣疾控中心是集疾病預防和控制、突發公共衛生事件應急處置、疫情及健康相關因素信息管理、健康危險因素監測與控制、實驗室檢測分析與評價、健康教育與健康促進、技術指導與應用研究于一體的社會公益類事業單位。
